تمام مراحل اجرای اتاق تمیز باید برای مونتاژ قطعات حساس الکترونیکی در شرایط کنترل‌شده طراحی شوند. انتخاب پانل‌های آلومینیوم کامپوزیت ضد استاتیک الزامی است تا خطر تخلیه الکتریکی کاهش یابد. درزگیری باید با نوارهای پلی‌یورتان مقاوم انجام گیرد و مسیر کابل‌ها و لوله‌ها باید در کانال‌های مخفی تعبیه شوند. کنترل رطوبت برای جلوگیری از آسیب به بردهای الکترونیکی باید اجرا شود.

سقف اتاق باید از تایل‌های سبک و ضد گردوغبار ساخته شود و فیلترهای HEPA و ULPA در نقاط کلیدی نصب گردند تا کلاس ISO 6 حفظ شود. کف‌پوش رزین اپوکسی آنتی‌استاتیک باید به‌کار رود و گوشه‌ها بدون زاویه تیز طراحی شوند تا از تجمع ذرات جلوگیری شود. پنجره‌های دو جداره باید بدون تاثیر بر ایزولاسیون دید واضح ایجاد کنند.

قبل از استفاده، آزمایش ذرات معلق، بررسی ولتاژ سطوح و تست جریان هوای تمیز باید انجام گیرد. نورپردازی باید از نوع LED کم‌حرارت باشد تا شرایط دما پایدار بماند. دسترسی به اتاق باید با کارت هوشمند کنترل شود و تمامی استانداردهای IEC و ISO رعایت شود.